CANVAS disease - repeat in RFC1 gene

CANVAS (cerebellaire ataxie, neuropathie, vestibulaire areflexie syndroom) is een autosomaal recessieve aandoening die veroorzaakt wordt door een expansie van een AAGGG-repeat in intron 2 van het RFC1 gen (OMIM*102579). Intronische expansies in het RFC1 gen kunnen voorkomen in verschillende conformaties. In deze test worden drie conformaties onderzocht: AAAAG, AAAGG en AAGGG. Enkel deze laatste wordt als pathogeen beschouwd (zie voor meer details: Cortese A et al Nat Genet. 2019 Apr;51(4):649-658).

Repeatlengten in het normale gebied worden bepaald met PCR. De PCR-producten worden met een hoge resolutie electroforese op een DNA sequencer geanalyseerd (±1 repeat bij normale waarden). Een expansie wordt gedetecteerd via TP-PCR. Hier worden de drie conformaties AAAAG, AAAGG en AAGGG afzonderlijk opgespoord.